Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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