Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms