Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms