Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms