Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms