Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP88Q99567 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms