Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms