Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms