Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BORCS6Q96GS4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms