Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF34Q969K3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF34Q969K3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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