Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4CQ8WTT0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms