Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGR3Q8TD06 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms