Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CSNK2A3Q8NEV1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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