Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms