Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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