Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SUSD1Q6UWL2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms