Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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