Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETSATQ6NUM9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms