Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBAP2Q5T6F2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms