Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms