Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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