Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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