Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDO1Q16878 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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