Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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