Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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