Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD5Q16401 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD5Q16401 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms