Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATP6AP1Q15904 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms