Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPEGQ15772 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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