Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms