Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms