Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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