Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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