Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SNTB2Q13425 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms