Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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