Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BNIP1Q12981 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms