Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.115e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 38.08□□□□□ -1.129e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 RHOT2-208ENST00000562957 397 ntTSL 27.91□□□□□ -1.149e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 WDR45-236ENST00000634852 763 ntTSL 57.9□□□□□ -1.149e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 LARGE2-210ENST00000534410 476 ntTSL 57.88□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.185e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 27.63□□□□□ -1.193e-10■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.219e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 EFTUD2-221ENST00000591856 366 ntTSL 37.47□□□□□ -1.219e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 NIT1-206ENST00000473918 223 ntTSL 37.45□□□□□ -1.229e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ACP1-213ENST00000484464 573 ntTSL 47.31□□□□□ -1.245e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 37.31□□□□□ -1.249e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 WDR26-202ENST00000443112 1306 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.249e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.245e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.254e-17■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 DMKN-234ENST00000471017 410 ntTSL 27.11□□□□□ -1.279e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ZNF789-207ENST00000481108 1018 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.299e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.295e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.97□□□□□ -1.299e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 TINF2-214ENST00000560019 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.97□□□□□ -1.299e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.339e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-205ENST00000505960 834 ntTSL 56.75□□□□□ -1.339e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 26.69□□□□□ -1.343e-7■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 EHMT1-206ENST00000465566 503 ntTSL 36.59□□□□□ -1.359e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-17■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.399e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SHARPIN-206ENST00000532536 533 ntTSL 36.23□□□□□ -1.419e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 IQGAP2-208ENST00000504815 596 ntTSL 36.19□□□□□ -1.429e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 26.18□□□□□ -1.429e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 YTHDF2-204ENST00000475796 358 ntTSL 26.1□□□□□ -1.439e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.01□□□□□ -1.459e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 TINF2-204ENST00000557915 565 ntTSL 25.96□□□□□ -1.469e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HNRNPA1-210ENST00000550994 569 ntTSL 45.92□□□□□ -1.469e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.479e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.73□□□□□ -1.499e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PLIN2-204ENST00000434144 623 ntTSL 35.69□□□□□ -1.55e-9■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 YTHDF2-205ENST00000476976 657 ntTSL 35.59□□□□□ -1.519e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 NT5DC1-202ENST00000417846 417 ntTSL 35.56□□□□□ -1.529e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 55.43□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.569e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 35.23□□□□□ -1.579e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.579e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ZC3H7A-215ENST00000576009 986 ntTSL 35.13□□□□□ -1.599e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CPSF7-210ENST00000474684 635 ntTSL 35.12□□□□□ -1.599e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 35.12□□□□□ -1.599e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.65e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 KHK-205ENST00000469936 553 ntTSL 45.05□□□□□ -1.69e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-203ENST00000502997 760 ntTSL 34.99□□□□□ -1.619e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SREK1-213ENST00000523655 606 ntTSL 54.99□□□□□ -1.613e-10■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.629e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PUS10-206ENST00000602599 6366 ntTSL 1 (best)4.85□□□□□ -1.635e-8■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-212ENST00000510768 725 ntTSL 54.76□□□□□ -1.659e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 USP13-204ENST00000497155 899 ntTSL 34.62□□□□□ -1.679e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PRPF3-204ENST00000470824 898 ntTSL 24.61□□□□□ -1.679e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.684e-17■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 ELP2-206ENST00000535093 582 ntTSL 44.45□□□□□ -1.79e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 TOX3-204ENST00000566696 3414 ntTSL 24.27□□□□□ -1.739e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 24.25□□□□□ -1.739e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 CENPK-217ENST00000515873 279 ntTSL 54.2□□□□□ -1.749e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 54.15□□□□□ -1.759e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 WDR26-204ENST00000477425 529 ntTSL 34.03□□□□□ -1.769e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PDCD5-206ENST00000588622 458 ntTSL 23.79□□□□□ -1.89e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 PDCD5-205ENST00000586316 480 ntTSL 23.77□□□□□ -1.819e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SREK1-206ENST00000519259 9353 ntTSL 23.48□□□□□ -1.853e-10■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 MEMO1-206ENST00000422936 327 ntTSL 53.31□□□□□ -1.889e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 KDM7A-203ENST00000478996 624 ntTSL 23.24□□□□□ -1.899e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 WDR26-209ENST00000489825 751 ntTSL 52.93□□□□□ -1.949e-6■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.973e-7■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 SLC38A2-203ENST00000547252 847 ntTSL 37.97□□□□□ -1.134e-10■■□□□ 12.4
SF3A3Q12874 FGFR3-206ENST00000469068 821 ntTSL 313.8□□□□□ -0.29e-8■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 MYO19-209ENST00000612097 580 ntTSL 58.49□□□□□ -1.052e-10■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.162e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 AFMID-212ENST00000591256 631 ntTSL 411.29□□□□□ -0.67e-16■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 AFMID-209ENST00000589107 577 ntTSL 411.29□□□□□ -0.67e-16■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 AFMID-204ENST00000586542 569 ntTSL 410.34□□□□□ -0.757e-16■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-222ENST00000582991 2152 ntTSL 518.4■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-223ENST00000584332 573 ntTSL 518.11■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-216ENST00000578614 527 ntTSL 414.21□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-203ENST00000395575 3640 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-204ENST00000446398 665 ntTSL 511.97□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-206ENST00000472059 3710 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ALDH3A2-207ENST00000476965 1383 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 12.3
SF3A3Q12874 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 12.3
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