Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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EFEMP1Q12805 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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