Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms