Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms