Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms