Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms