Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms