Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms