Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms