Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF8Q02556 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms