Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB1P98172 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms