Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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