Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RPS29P62273 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
RPS29P62273 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
RPS29P62273 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
RPS29P62273 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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