Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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