Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms